Duda Ernő az SZTE Orvosi Biológiai Intézetének, korábban a Mikrobiológiai és Immunbiológiai Intézetének egyetemi tanára, a Biológiai Kutatóközpont tudományos tanácsadója, az MTA doktora. Tudományos pályáját a Budapesti Orvosegyetem Straub F. Brunó akadémikus vezette Orvosi Vegytani Intézetében kezdte. Az SZBK-nak megalakulása óta munkatársa, több éven át dolgozott külföldi egyetemeken, kutatóintézetekben (St. Louis és New York, USA, Torontó, Kanada, Nizza, Franciaország és Fukuoka, Japán).

Kutatási területe a molekuláris biológia, az immunrendszer működését összehangoló fehérjék, a citokinek vizsgálata, a tumor- és virus-ellenes immunterápia. Jelenleg munkatársaival egy immunológiai eredetű, vakságot okozó betegség elleni hatóanyag fejlesztésén dolgozik.

A Szegedi Tudományegyetemen kívül rendszeresen tart előadásokat a budapesti (ELTE, SE), a marosvásárhelyi és a csíkszeredai egyetemeken is.