Dr. Fülöp Ferenc okleveles vegyész diplomáját 1975-ben a József Attila Tudományegyetemen szerezte meg, 1978-ban egyetemi doktori címet, majd 1983-ban kandidátusi fokozatot szerzett, 1990 óta a kémiai tudomány doktora. 2007-től az MTA levelező tagja.

1975 óta vesz részt az egyetemi oktatói munkában. 1991-től egyetemi tanár, 1996-1997 között a Gyógyszeranalitikai Intézet megbízott vezetője; 1998-tól az SZTE Gyógyszerkémiai Intézet vezetője, 2005-2006 között az SZTE Szerves Kémiai Tanszék megbízott vezetője. 2006-tól az SZTE Gyógyszerésztudományi Kar dékánja.

Kutatási tevékenysége során a telített heterociklusok szintézisének konformációit, gyűrű-lánc tautoméria-vizsgálatokat, ciklusos b-aminosavak szintézisét, önszervezödő b-peptidek szerkezetét, alkalmazásait vizsgálta, valamint felfedező gyógyszerkutatást is végzett.

Munkája során 430 eredeti, idegen nyelvű tudományos közlemény, 16 összefoglaló, 79 magyar nyelvű közlemény és 19 szabadalom társfeltalálója lett. Hazai és nemzetközi konferenciákon egyaránt és munkabizottsági üléseken volt előadásszerző vagy társszerző.

Összesen 30 alkalommal volt meghívott előadó külföldön. 1986-1995 között a Finn Tudományos Akadémia ösztöndíjával összesen 9 alkalommal 1-6 hónapos tanulmányutat tett meg a Turkui Egyetem Kémiai Tanszékén, 1994-ben az Európai Közösség ösztöndíjával 3 hónapig a Bonni Egyetem Szerves és Biokémiai Intézetében dolgozott. 3 évvel később 2 hónapot töltött el a skóciai School of Chemistry, St. Andrews egyetemen.

1988-ban "Kiváló Munkáért" Miniszteri Kitüntetésben részesült. 1991-ben Miniszteri Dicséretet kapott a TDK oktatómunkáért; azóta több ízben nyerte el az “Év legjobb oktatója” díjat. 1997 és 2000 között Széchényi Professzori Ösztöndíjas, kutatómunkájáért számos neves hazai és nemzetközi díjban részesült.