Szegedi Tudományegyetem - Ahol tudás és szándék találkozik

Ajánlat sorszáma: SZTE/2011/PSZ0140.

 

Ajánlattételi határidő: 2011. 12. 05.  15 óra

 

A beszerzés rövid ismertetése:

 

A szolgáltatás tárgya, feladatok rövid leírása

 

A PRIMER SZENZOROS NEURONOK GÉN-EXPRESSZIÓJÁNAK VIZSGÁLATA PERINEURÁLIS CAPSAICIN KEZELÉST KÖVETŐEN projektjének keretében újgenerációs szekvenálással történő transzkriptóma meghatározás.

Minimumkövetelmények:

-       rövid, 35 bázispáros leolvasási hosszak a kiindulási RNS minta enzimatikus fragmentálásának köszönhetően

-       multiplexelés lehetősége, vagyis kémiai vonalkódozás (bárkódolás) 

-        nagy áteresztőképességű szekvenátor (8-10x-es lefedettséggel történő humán genom szintű szekvenálás, azaz legalább 50 Gbázis térképezhető szekvencia futásonként)

-        részletes bioinformatikai analízis: a leolvasott szekvenciák annotált patkány genomra történő illesztése, csoportok összehasonlítása és különböző mértékben kifejeződő gének/géncsoportok azonosítása

Az elvégzendő szolgáltatás leírása:

· fagyasztott mintákból RNS izolálás

· az izolált RNS minőségi és mennyiségi meghatározása: többféle módszerrel, de követelmény a lab-on-a achip technológia használata

· megfelelelő minőségű és mennyiségű izolált RNS esetén az RNS-ek feldolgozása annak érdekében, hogy a későbbiekben transzkriptóma analízist végezzenek rajtuk SAGE-Seq, azaz Digital Gene Expression; DGE módszerrel.

· Újgenerációs Szekvenálási módszerrel történő transzkriptóma analízis SAGE-Seq során a teljes RNS-ból oligodT gyöngyökkel dúsítják a polyA RNS-eket amely dúsított frakciót templátként felhasználva először enzimatikusan fragmentálják majd a megfelelő adaptorok ligálása után elkészítik a szekvenáló templátokat

· a szekvenálás során mintánként ~20 millió, egyenként 35bp hosszú szekvenciákat (tag) generálnak

· a keletkezett tag-eket bioinformatikai módszerekkel visszaillesztik az annotált patkány referencia genomra, végül meghatározzák a gén-kifejeződésbeli különbségeket.

· az eltérően kifejeződő géneket QRT-PCR módszerrel validálják

Teljesítési határidő (a szerződéskötéstől): 30 naptári nap

 

Becsült érték (nettó): 4.800.000.- Ft

 

Feladatellátás helye:

 

SZTE ÁOK Élettani Intézet

6720 Szeged, Dóm tér 10.  

 

Számlázási cím:

Szegedi Tudományegyetem

6720 Szeged, Dugonics tér 13.

 

Fizetési mód: A szolgáltatás díja átutalással, egy összegben kerül kifizetésre a számla kézhezvételétől számított 30 napon belüli fizetési határidővel, az Intézet által igazolt teljesítést követően.

A projekt száma: TÁMOP-4.2.1/B-09/1/KONV-2010-0005

 

Címe, megnevezése: Kutatóegyetemi Kiválósági Központ létrehozása a Szegedi Tudományegyetemen

 

Bírálati szempontok:

1. Ajánlati ár …………....(nettó Ft) Súlyszám: 5

 

2. Szekvenciameghatározás pontossága. legalább 99,9% (igen/nem)  Súlyszám: 1

3. Legalább 50 millió szekvencia tag leolvasása/futás (igen/nem) Súlyszám: 2

 

4. Alcsoport elkülönítésének lehetősége (barcode, szekvencia tag)

 egy lemezen (igen/nem)  Súlyszám: 1

 

5. Minta előkészítési segítség, tapasztalatok megosztása: a minták RNS tisztítása, visszaizolálása, mennyiségi és minőségi ellenőrzése (igen/nem)  Súlyszám: 1

 

Ajánlatkérő az összességében a legelőnyösebb ajánlatot hirdeti nyertesnek.

 

Pontozási szabályozás:

Az adott szempont szerinti legkedvezőbb értéket elérő ajánlattevő 10 pontot kap, míg a többi az ajánlatához képest arányosított pontot, mely felszorzásra kerül a súlyszámmal. Az egyes szempontok szerint kapott pontértékek összeadását követően a legtöbb pontot kapott ajánlattevő a nyertes.

 

Az eljárásban nem lehet ajánlattevő, alvállalkozó aki

a)  Végelszámolás alatt áll, vagy vonatkozásában csődeljárás elrendeléséről szóló bírósági végzést közzétettek, vagy az ellene indított felszámolási eljárást jogerősen elrendelték.

b)  Olyan gazdálkodó szervezet, amelynek tagja, vagy vezető tisztségviselője gazdasági, illetőleg szakmai tevékenységével kapcsolatban jogerős bírósági ítéletben megállapított bűncselekményt követett el, amíg a büntetett előélethez fűződő hátrányok alól nem mentesült; illetőleg olyan gazdálkodó szervezet, amelynek tevékenységét a jogi személlyel szemben alkalmazható büntetőjogi intézkedésekről szóló 2001. évi CIV. törvény 5. §-a (2) bekezdésének b), illetőleg g) pontja alapján a bíróság jogerős ítéletében korlátozta, az eltiltás ideje alatt, illetőleg ha az ajánlattevő tevékenységét más bíróság hasonló okból és módon jogerősen korlátozta.

c)  A közbeszerzési eljárásokban való részvételtől jogerősen eltiltásra került, az eltiltás ideje alatt.

d) Egy évnél régebben lejárt adó-, vámfizetési vagy társadalombiztosítási járulékfizetési kötelezettségének nem tett eleget, kivéve, ha megfizetésére halasztást kapott.

e)  Korábbi – három évnél nem régebben lezárult – közbeszerzési és egyéb pályázati eljárásban hamis adatot szolgáltatott és ezért az eljárásból kizárták, illetőleg a hamis adat szolgáltatását jogerősen megállapították, a jogerősen megállapított időtartam végéig.

Figyelem! Ajánlattevő nyilatkozzon, hogy a fenti kizáró okok hatálya alatt nem áll.

Figyelem! Kérem, hogy Vállalkozó az ajánlatával egyidőben nyújtsa be az alábbi nyilatkozatot.

A vállalkozó összeférhetetlenséget kizáró és egyben  a teljesítés feltételeit igazoló nyilatkozata

 

Alulirott (…..), mint a(z) (….. ) képviseletére feljogosított személy kijelentem, hogy az általam képviselt vállalkozás és a Szegedi Tudományegyetem között (…..)-án létrejött,  (….) tartalmú kutatás-fejlesztési megállapodással kapcsolatosan nem áll összeférhetetlenség, azaz

 

-egyfelől a feladat végrehajtásával összefüggésben a Vállalkozás egyetlen alkalmazottja sem kerül a Szegedi Tudományegyetemen közalkalmazottként dolgozó közeli hozzátartozójával irányítási (felügyeleti), ellenőrzési vagy elszámolási kapcsolatba (a közeli hozzátartozó fogalmának értelmezésében a Munka Törvénykönyve 139.§ (2) bekezdése az irányadó).

-másrészt a Vállalkozás egyetlen vezető tisztségviselője vagy felügyelő bizottsági tagja sem közalkalmazottja a Szegedi Tudományegyetemnek, illetve ha igen, akkor a Vállalkozásnál létesített eme jogviszonyára a Szegedi Tudományegyetemtől előzetes írásbeli engedélye van.

Kijelentem továbbá, hogy a fenti megállapodásban rögzített kutatási feladat elvégzéséhez Társaságunknál a szükséges erőforrás, technológia valamint eszköz- és műszerpark rendelkezésre áll, illetve amennyiben fentiek bármelyike részben vagy egészben hiányzik, akkor azt nem a Szegedi Tudományegyetemtől veszem bérbe.

Dátum, aláírás

Ajánlat benyújtásának módja: Zárt borítékban 1 eredeti példányban, a Szegedi Tudományegyetemnek címezve: SZTE Gazdasági és Műszaki Főigazgatóság Szeged, Szentháromság utca 34, személyesen vagy postai úton. A borítékon és a dokumentációban kérjük feltüntetni az ajánlati sorszámot. Érvényes ajánlat eljuttatható e-mailen (viszmeg.ivett@gmf.u-szeged.hu) keresztül is pdf formátumban, a felhívásban közzétett határidőre történő megküldéssel.

Amennyiben e-mailen keresztül történik az ajánlat eljuttatása, akkor a levél „Tárgyánál” kérem feltüntetni az eljárás sorszámát.

 

További információ kérhető:

 

Az ajánlatkérő hivatalos kapcsolattartója: Ifkovics Kálmán ellátási főosztályvezető

 

SZTE GMF Ellátási Főosztály

 

ifkovics.kalman@gmf.u-szeged.hu

 

Az ajánlatkérő szakmai kapcsolattartója:

név: Jász Anikó, Dr. Sántha Péter

telefon: +36-62-545-101, +36-62-545-374

email: iroda@phys.szote.u-szeged.hu,

santha@phys.szote.u-szeged.hu

 

Az eljárás nyelve: magyar, de az ajánlatkérő angol nyelvű ajánlatot is elfogad. Jelen felhívással Ajánlatkérő olyan cégek jelentkezését várja, akik megfelelő pénzügyi háttérrel rendelkeznek valamint képesek a mielőbbi szolgáltatásra. Az ajánlatkérő fenntartja magának a jogot, hogy az ajánlattevőktől további írásbeli tájékoztatást kérjen 5 munkanapon belül, a tájékoztatási igény minden ajánlattevőnek történő egyidejű megküldésével, az érvényes jelentkezések alapján. Ezek után az ajánlatkérő elvégzi az ajánlatok értékelését, amelynek eredményéről a lehető legrövidebb időn belül értesíti az Ajánlattevőket.

 

Ajánlatkérő fenntartja magának a jogot, hogy a jelen felhívás lefolytatásától indoklás nélkül részlegesen, illetve teljes mértékben elálljon. Az Ajánlatkérő nem vállal felelősséget az elállásból származó következményekért.

 

A jelen felhívás egyetlen Ajánlattevő által sem tekinthető az Ajánlatkérő által tett szerződéses ajánlatnak vagy kötelezettségvállalásnak. A felhívás és a pályázati eljárás az Ajánlatkérő belső szabályai alapján történik.

 

Az eljárás nyertese: Magyar Tudományos Akadémia Szegedi Biológiai Kutatóközpont

 

Vállalási ár: 4.795.000,-Ft+Áfa