Szegedi Tudományegyetem - Ahol tudás és szándék találkozik

Ajánlat sorszáma: SZTE SZAKK/2012/KB0004

Ajánlattételi határidő: 2012.01.16. 16 ⁰⁰

A kezdés tervezett időpontja: 2012. 02. 01.

A felhívás rövid ismertetése:

1. Szolgáltatás – DNS minták célzott újraszekvenálása újgenerációs szekvenáló platformon

Leírás:

Általános információk:

Igénylő egység pontos megnevezése címe:

 

SZTE-SZAKK, II. sz. Belgyógyászati Klinika és Kardiológiai Központ

Szeged, Korányi fasor 6.

 

Szolgáltatás tárgya, feladatok rövid leírása:

 

DNS minták célzott újraszekvenálása újgenerációs szekvenáló platformon.

 

A munka során (továbbiakban) a Megrendelő által rendelkezésre bocsájtott vér a kiindulási minta, Megrendelő a következő feladatok ellátását kéri:

 

-DNS tisztítása a rendelkezésre bocsájtott vérből;

-mintaszám: 50;

-a megjelölt (target) DNS szakasz mérete: kb. 0.5 Mb (500.000 bp)

-a dúsító oligók DNA vagy RNS alapúak, hosszuk min. 60bp

-a tisztított DNS dúsítása a fent nevezett oligókkal;

-a dúsított DNS fragmensek szekvenálása újgenerációs szekvenáló készüléken, tagek hossza: min.50bp, max. 200bp

-mintánként >5 millió tag generálása;

-a kapott tag-ek minőségi szűrése;

-a szűrt, jó minőségű tag-ek illesztése a Megrendelő által megjelölt humán genomra, variánsok (SNP,  MNP, indel) azonosítása

-az 50 illesztés összehasonlítása, egyedi variánsok azonosítása,

-az egyedi variánsok validálása hagyományos kapilláris szekvenálással.

 

Bírálati szempontok

Árajánlat (5); a legalacsonyabb ár a legtöbb pont

Dúsító oligók hossza (3); a leghosszabb tag a legtöbb pont

Generált tag-ek száma (3); a legmagasabb tag a legtöbb pont

Szekvenálás pontossága (2); a legnagyobb pontosságú szekvenálás a legtöbb pont

 

Feladatellátás helye: SZTE-SZAKK, II. sz. Belgyógyászati Klinika és Kardiológiai Központ

Szeged, Korányi fasor 6.

 

Teljesítési határidő/részhatáridők (szerződéskötéstől): szerződés megkötésétől számított 60 nap

Szakmai kapcsolattartó és elérhetőségei a megrendelő intézet részéről:

név: Dr. Sepp Róbert

telefon, fax: 06 62 541 234/ 545-237

email: seppr@freemail.hu

 

Az ajánlatok értékelése soronként, az ajánlati ár figyelembevételével történik. Kérjük ajánlatukban tüntessék fel, hogy ajánlatuk mely sorra vonatkozik.

Ajánlat benyújtásának módja: Zárt borítékban 1 eredeti példányban, a Szegedi Tudományegyetemnek címezve: SZTE SZAKK GH Logisztikai Osztály, Szeged, Semmelweis u. 8., személyesen vagy postai úton. A borítékon és a dokumentációban kérjük feltüntetni az ajánlati sorszámot. Érvényes ajánlat eljuttatható e-mailen keresztül is pdf formátumban, a varjasi.otto@med.u-szeged.hu e-mail címre és határidőre történő megküldéssel.

További információ kérhető:

Az ajánlatkérő hivatalos kapcsolattartója: Varjasi Ottó ov. Logisztikai Osztály, ügyintéző: Molnár András előadó 62/545-645

Az eljárás nyelve: magyar, de az ajánlatkérő angol nyelvű ajánlatot is elfogad. Jelen felhívással Ajánlatkérő olyan cégek jelentkezését várja, akik megfelelő pénzügyi háttérrel rendelkeznek valamint képesek a mielőbbi szállítására. Az ajánlatkérő fenntartja magának a jogot, hogy az ajánlattevőktől további írásbeli tájékoztatást kérjen 5 munkanapon belül, a tájékoztatási igény minden ajánlattevőnek történő egyidejű megküldésével, az érvényes jelentkezések alapján. Ezek után az ajánlatkérő elvégzi az ajánlatok értékelését, amelynek eredményéről a lehető legrövidebb időn belül értesíti az Ajánlattevőket.

Ajánlatkérő fenntartja magának a jogot, hogy a jelen felhívás lefolytatásától indoklás nélkül részlegesen, illetve teljes mértékben elálljon. Az Ajánlatkérő nem vállal felelősséget az elállásból származó következményekért.

A jelen felhívás egyetlen Ajánlattevő által sem tekinthető az Ajánlatkérő által tett szerződéses ajánlatnak vagy kötelezettségvállalásnak. A felhívás és a pályázati eljárás az Ajánlatkérő belső szabályai alapján történik.

A pályázat nyertese: MTA Szegedi Biológiai Központ

Vállalási ár: 6 299 000 Ft + Áfa