Feladat: Kísérletek során vizsgált génexpressziós változások mélyreható, pontos és érzékeny detektálása (Deep Gene Expression Profile analízis) érző idegdúc mintákból
Szenzoros neuronok transzkriptomikai analízise új generációs szekvenálási eljárással (Deep Gene Expression Profile analízis) ami magába foglalja:
1. Az elküldött szövetmintákból (28 db) teljes RNS izolálása
Idegdúc mintákból történő totál RNS izolálás elvégzése, amelynek végterméke megfelelő tisztaságú és minőségű RNS, amely alkalmas további transzkriptomikai (elsődlegesen „Next-Generation Sequencing”) vizsgálatban történő felhasználásra. Az alkalmazott módszernek képesnek kell lennie magas minőségben RNS izolálására 1-10 mg szövetből. Ezt követően fluorometriás RNS koncentráció mérés olyan módszer segítségével, amely képes az RNS szelektív mérésére és megkülönböztetésére DNS-től, fehérjéktől, szabad nukleotidoktól akár már kis koncentráció tartományban is (≥0.2 ng/µL).
2. Az elküldött Izolált RNS minták (28 db) génexpressziós profilozása
Elsőként szükséges az RNS izolátumok minőségellenőrzésének elvégzése olyan elektroforézis alapú módszerrel, amely egyrészt alkalmas a mintában található RNS-ek méretének, mennyiségének és integritásának meghatározására kis mintamennyiség-igény (1-2 µL) mellett, másrészt kompatibilis a „next-generation sequencing” típusú vizsgálatokban történő felhasználással. Ezt követően szál-specifikus, 3´mRNA-Seq könyvtárkészítés akár kismennyiségű (≥1 ng) totál RNS mintából is. Végül pedig az elkészült könyvtárak szekvenálása Illumina platformon teljes garanciával, minőségbiztosított módon 20 millió mintánkénti átlagos single-end read szám garantálásával minimum read hossz: 50 bp
3. Adatszolgáltatás
A kapott mérési eredményeket, jegyzőkönyveket, riportokat és a szekvenálás nyersadatait FastQ formátumban a szolgáltató a megrendelő rendelkezésére bocsájtja
Elvárt eredmény:
- laboratóriumi jegyzőkönyvek az elvégzett szekvenálásról
kimeneti szekvenálási és kiértékelési adattáblázatok transzfere
Az ajánlatban feltüntetendő adatok
Az ajánlati ár csak forintban (HUF) adható meg, amennyiben a benyújtott ajánlaton forintos (HUF) ár nem szerepel, az ajánlatot érvénytelennek nyilvánítjuk!
Fizetési feltételek: megrendelés teljesítése után utólag, 30 napos átutalással
Számlázási cím:
Szegedi Tudományegyetem, 6720 Szeged, Dugonics tér 13.
Számlaküldési cím: SZTE SZAOK Anatómiai, Szövet-és Fejlődéstani Intézet, 6724 Szeged, Kossuth L. sgt. 38.
Projekt száma: NKFI (OTKA) K - 138568
Projekt címe: A gangliozidok spinális fájdalom mechanizmusokban betöltött szerepe
Tájékoztatjuk Tisztelt Szállítót, hogy pályázati forrásból finanszírozott eljárásban az elszámolható ajánlatoknak az alábbi minimumkövetelményeknek kell megfelelniük:
Az ajánlatkérő szakmai kapcsolattartója:
Csókásiné Tóth-Kása Matild ügyintéző
Telefon: +36-62/545-877
E-mail: csokasine.toth-kasa.matild@med.u-szeged.hu
Kérjük, hogy a kiírással kapcsolatosan felmerülő kérdéseket a megadott szakmai kapcsolattartó mellett a beszerzést intéző részére (naszne.macsai.anita@szte.hu) is feltétlen küldjék meg!
Ajánlatkérő a 28 mintára megadott mindösszesen bruttó árat fogja értékelni a bírálat során.
Ajánlattevővel szembeni elvárások:
„Ajánlattevő minősüljön átlátható szervezetnek az államháztartásról szóló 2011. évi CXCV. törvény 41. (6) bekezdésében foglaltak alapján. Ajánlatkérő az ajánlatok értékelésekor ellenőrzi, hogy az átláthatóság igazolására szolgáló dokumentum nyilvántartásában rendelkezésre áll-e, szükség esetén az átláthatósági nyilatkozatot hiánypótlásban kéri be.”
Ajánlati kötöttség a bontás napjától számított 30 nap.
„Az SZTE Beszerzési Igazgatóság nyílt ajánlattételi (Webra) rendszer keretén belül lebonyolított beszerzési eljárásai során a beszerzési szabályzat lehetőséget nyújt az Ajánlattevők részére iratbetekintésre meghatározott feltételek mellett. A fentiek alapján tájékoztatjuk az Ajánlattevőket, hogy ajánlatukban az üzleti titkot tartalmazó iratok nyilvánosságra hozatalát megtilthatják. Az üzleti titkot tartalmazó irat kizárólag olyan információt tartalmazhat, amelynek nyilvánosságra hozatala az ajánlattevő üzleti tevékenysége szempontjából aránytalan sérelmet okozna. Ajánlattevő nem tilthatja meg nevének, címének (székhelyének, lakóhelyének), valamint olyan adatoknak a nyilvánosságra hozatalát, amelyek az értékelési szempont(ok) alapján értékelésre kerülnek, az alkalmasság igazolása körében bemutatott adatokat, továbbá az ajánlatban meghatározott áruk, építési beruházások, szolgáltatások leírását, kivéve a leírásnak azt a jól meghatározható, elkülönített elemét, amelynek nyilvánosságra hozatala az ajánlattevő üzleti tevékenysége szempontjából aránytalan sérelmet okozna.”
Nyertes ajánlattevő: Xenovea Szolgáltató Kft.
Nyertes ajánlati ár: 1 540 000,-Ft+ÁFA
BTK ,Diplomaosztó ,Egyetemi Tavasz ,Egyetemi Élet ,Egyetemi élet ,Esemény ,Fókusz ,Innovízió ,Irodalom ,JGYPK ,Kulturális Iroda ,Kultúra ,Kutatók Éjszakája 2009 ,SZTE Kulturális Iroda ,SZTE Kultúrális Iroda ,Sport ,Szabadegyetem ,TIK ,TTIK ,ZMK ,