Határokon átívelő fejlesztés a mikrobiológia kutatások és vizsgálatok előrelépéséért

Az antimikrobiális rezisztencia napjaink egyik legjelentősebb globális népegészségügyi kihívása. A baktériumok egyre gyakrabban válnak ellenállóvá az antibiotikumokkal és egyéb antimikrobiális szerekkel szemben, ami a korábban hatékony kezelések eredményességének csökkenéséhez vezet. Ennek következtében a fertőzések kezelése nehezebbé és költségesebbé válik, növelve a megbetegedések és a halálozás kockázatát.
A METAGEN projekt célja egy átfogó antibiotikum-rezisztencia génadatbázis és az arra épülő cselekvési terv kialakítása, amely a Nanopore szekvenálási adatok felhasználásával segíti az infekciókontrollt és az antibiotikum-gazdálkodást. A régióban előforduló rezisztenciagének típusainak és gyakoriságának megismerése lehetővé teszi a multirezisztens kórokozók terjedésének hatékonyabb visszaszorítását és az antibiotikumok célzottabb alkalmazását. A projekt egyik leginnovatívabb eleme az Oxford Nanopore Technológián (ONT) alapú szekvenálás bevezetése a kórokozók vizsgálatába. Ez a harmadik generációs szekvenálási technológia lehetővé teszi a DNS- és RNS-molekulák közvetlen detektálását, ezáltal olyan részletes információt szolgáltat, amely egyaránt segíti a diagnosztikát és a terápiás döntéshozatalt.
A Nanopore szekvenálás lehetővé teszi, hogy a mintavételt követően akár 24 órán belül azonosítsuk a kórokozókban jelen lévő antibiotikum-rezisztencia géneket, ezáltal gyors és megalapozott információt szolgáltatva a várható antimikrobiális érzékenységről. Ez jelentős előrelépést jelent a hagyományos tenyésztésen és fenotípusos érzékenységi vizsgálatokon alapuló módszerekhez képest, amelyek eredményei gyakran csak több nap elteltével állnak rendelkezésre. A projekt során bevezetett új módszer lehetővé teszi a kórokozók gyors és egyértelmű, törzsszintű azonosítását, új perspektívát nyitva a fertőző betegségek kezelésében. A Nanopore szekvenálás, a TapeStation rendszer és az IR Biotyper együttes alkalmazása gyors megoldást biztosít a kórházi eredetű fertőzések, valamint a rezisztencia- és virulenciagének kimutatására, támogatva a valós idejű epidemiológiai vizsgálatokat.
Az IR Biotyper rövid időn belül eredményt szolgáltat, így gyors higiénés és infekciókontroll-intézkedések indíthatók. A projekt részeként a magyar kutatók Temesváron vettek részt a Nanopore szekvenálással kapcsolatos elméleti és gyakorlati képzésen, míg a román kollégák Szegeden sajátították el az IR Biotyper alkalmazását. Ezek a tréningek jelentősen hozzájárultak a határon átnyúló tudástranszferhez és a módszerek egységes bevezetéséhez.
A Nanopore szekvenálás és az IR Biotyper alkalmazása kiemelkedő klinikai és tudományos értéket képvisel, jelentősen erősítve a diagnosztikus mikrobiológiát és a kórházhigiénés tevékenységet a magyar–román határ menti régióban.

A szerződött támogatás összege: 2.266.696,33 EUR
Európai Uniós hozzájárulás: 1.813.357,05 EUR

Konzorciumi partnerek és a támogatási összeg megosztása:

Vezető partner: Victor Babeș Orvosi és Gyógyszerészeti Egyetem Temesvár: 1.206.285,76 EUR
Konzorciumi partner 1.: Szegedi Tudományegyetem 993.370,00 EUR
Konzorciumi partner 2.: OncoHelp Egyesület: 67.040,57 EUR
A projekt megvalósítási időszaka: 2025.07.02. – 2028.01.01.

A projektet az Európai Unió az Interreg Alapból támogatja, Románia és Magyarország társfinanszírozásával.